Dear Gmx Users,<br><br>My system is made of 3 proteins. As I want to use distance restraints dynamics between atoms belonging to each of them I have to produce topoloy with one moleculetype. I used pdb2gmx -chainsep interactive (I used merge: yes). <br>
<br>Then when I process to grompp the error: &quot;unknown cmap torsion between atoms  .......&quot;<br><br>These atoms belong to the last residue of the chain A and to the first residue of Chain B. How to get rid of this? Please, help.<br>
<br>Steven<br>