<html>
<head>
<style><!--
.hmmessage P
{
margin:0px;
padding:0px
}
body.hmmessage
{
font-size: 10pt;
font-family:Tahoma
}
--></style></head>
<body class='hmmessage'><div dir='ltr'>
one conect record for all models? <br>thanks-<br><div><div id="SkyDrivePlaceholder"></div><hr id="stopSpelling">Date: Sun, 27 May 2012 20:24:59 +0200<br>Subject: Re: [gmx-users] trjconv -conect<br>From: tsjerkw@gmail.com<br>To: jalemkul@vt.edu; gmx-users@gromacs.org<br>CC: <br><br>Hi Vijaya,<BR>
Just copy the CONECT records from the reference pdb afterwards.<BR>
Cheers,<BR>
Tsjerk<BR>
<BR><blockquote>On May 27, 2012 7:42 PM, "Justin A. Lemkul" &lt;<a href="mailto:jalemkul@vt.edu">jalemkul@vt.edu</a>&gt; wrote:<br><br><font color="#500050">

On 5/27/12 1:36 PM, vijaya subramanian wrote:
</font><BR><blockquote class="ecxgmail_quote" style="border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Hi<font color="#500050">
&gt; I don't have a .tpr file for the cg system. I am anlayzing results from pca and
&gt; the trajectorie...</font><BR></blockquote>
<br>
Not without your own custom force field. &nbsp;No Gromacs force field is compatible with CA-only models. &nbsp;There are a few scripts on the User Contribution site that may be useful.<font color="#888888"><br>
<br>
-Justin<br>
<br>
</font><blockquote class="ecxgmail_quote" style="border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><font color="#500050">&gt; &nbsp;&gt; Date: Sun, 27 May 2012 12:12:14 -0400
&gt; &nbsp;&gt; From: <a href="mailto:jalemkul@vt.edu">jalemkul@vt.edu</a>
&gt; &nbsp;&gt; To: gmx-users@gromacs.org...</font><BR><font color="#500050">&gt; &nbsp;&gt; On 5/27/12 12:05 PM, vijaya subramanian wrote:
&gt; &nbsp;&gt; &gt;
&gt; &nbsp;&gt; &gt; Hi
&gt; &nbsp;&gt; &gt; I am trying to add conec...</font><BR></blockquote><font color="#500050">

-- 
========================================

Justin A. Lemkul, Ph.D.
Research Scientist
Departmen...</font><BR></blockquote><BR>
<br>-- 
gmx-users mailing list    gmx-users@gromacs.org
http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users
Please search the archive at http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search before posting!
Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the 
www interface or send it to gmx-users-request@gromacs.org.
Can't post? Read http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</div>                                               </div></body>
</html>