<font>Dear Justin and Gmx users,<br><br>I want to extend my simulation in each window of 20 ns. For this purpose I should use (example - window 0):<br><br></font><pre><font>tpbconv -s umbrella0.tpr -extend 20000 -o umbrella0extend.tpr
mdrun -s umbrella0extend.tpr -cpi umbrella0.cpt -deffnm umbrella0 -pf pullf0.xvg -px pullx0.xvg</font><br><br><br><br></pre><font>My questions:<br>1. Do I have to use -deffnm , -px, -pf or without this my files will be updated to the one produced before?<br>
2. Will the umbrella0extend.tpr shall be used for a g_wham or my previous umbrella0.tpr combined with umbrella0extend.tpr? How to combine them?<br><br>Thank you,<br><br>Steven<br></font>