Dear all,<div><br></div><div>Recently i performed  two 15ns simulation of  protein-ligand systems using gromacs of my interest...and using g_energy tool..i calculated crude</div><div>interaction energy based on short-­‐range energy components Eint = &lt;ELJ&gt; + &lt;ECoul&gt;. ...I got two Eints for two simulations</div>
<div><br></div><div>1) Eint = -51.003 Kcal/mol (first simulation)</div><div>2) Eint = -26.615 Kcal/mol (second simulation)</div><div><br></div><div>Can anybody tell me what meaning can i make out of it...means is first simulation is more stable than second one..or vice versa...</div>
<div><br></div><div>Thanks in advance</div><div><br></div><div>Regards</div><div>-- <br><span><br>Sainitin D</span> <br><br>
</div>