Dear Gromacs users!<br><br><br>In this task I have two systems:<br><br>First system consist of single layer of Ccl4 molecules.<br><br>Second system consist of membrane-mimicking layer of Ccl4 surrounded by water and the protein embedded in that biphastic layer.<br>
<br>I&#39;d like to measure density in both of my systems to check of its packing degree. How could I do it in the case of homo system- (where I&#39;d like to check density in the Ccl4 layer only) as well as in more complex hetero  system ( where I&#39;d like to check density in each layer separately as well as compute averaged density among all layers) ?<br>
<br><br>Thanks for advises,<br><br>James S. <br>