<br>Thank you Justin for giving your valuable time to solve<br>my stupid problems.<br><br><br><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div class="HOEnZb">
<div class="h5"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<br>
</blockquote>
<br></div></div>
You can use either.  I have never tried it, but there is no reason to believe there will be any substantive reason during data collection.  The production MD period is significantly longer than the equilibration, and the results will likely turn out the same, when considering error estimates.  Sufficient sampling of any series of simulations should converge.<div class="HOEnZb">
<div class="h5"><br>
<br>
-Justin<br><br></div></div></blockquote><div><br><br>With Best Wishes,<br>Rama David.<br> <br></div></div>