Dear all gromacs users,<br><br>                                  While i am running pdb2gmx commond i am getting following error.<br><br>Fatal error:<br>
There were 22 missing atoms in molecule Protein_chain_A, if you want to use<br>
this incomplete topology.<br><br>I wont ignore the 22 missing atoms by using -missing commond. I would like to construct a complete protein structure.But i dont know how to construct the complete protein sturcture.Kindly tell me how to consturct the complete protein and what are the softwares i have to use here.<br>
<br>Suryanarayana Seera,<br>PhD student,<br>Hyderabad,<br>India.<br>   <br><br><br><br><br><br>