<br>

<p class="MsoNormal"><span style>Hi all,</span></p><p class="MsoNormal"><span style><br></span></p>

<p class="MsoNormal"><span style>I would like to get
information about <b style>pi-pi stacking</b>, <b style>van der Waals</b>, <b style>electrostatic and hydrophobic interactions</b> for my system
(several-peptides in a box filled with water). Can Gromacs compute these
interactions? </span></p>

<p class="MsoNormal"><span style><br></span></p><p class="MsoNormal"><span style>As far as I see from
mailing-list, to get information on <b style>hydrophobic
interactions</b>, g_mindist and g_sas can be used. But, they look very
different. Which one should be used?</span></p>

<p class="MsoNormal"><span style><br></span></p><p class="MsoNormal"><span style>I would deeply appreciate
your response. </span></p>

<p class="MsoNormal"><span style>My best regards,</span></p>

<p class="MsoNormal"><span style>Turgay,</span></p>

<br>