<html><body><div style="color:#000; background-color:#fff; font-family:arial, helvetica, sans-serif;font-size:12pt"><div>Dear Gromacs users</div><div>Today I encountered a new error.</div><div>I want to calculte RDF for my protein's (alpha-c) dissolved in water.</div><div><br></div><div>when I use the command line:</div><div style="background-color: rgb(255, 255, 255); font-weight: bold;">g_rdf -f traj.xtc -s topol.tpr -o rdf.xvg</div><div style="background-color: rgb(255, 255, 255); font-weight: bold;"><br></div><div>and I choose 3 for (C-alpha) for both the reference and target groups, every thing goes well and I will have the rdf plot.</div><div><br></div><div>Now if I add option <span style="font-weight: bold;">(-xy)</span> to use the only x and y components, and then I choose my two groups, the program does not do anything and it stops !!</div><div>This is right even for the lyzozyme protein in Justin's tutorial.</div><div><br></div><div>Do you have
 any idea on this?</div><div>Thanks</div><div>Regards</div><div>D.M</div></div></body></html>