<br>Hi Gromacs Friends,<br><br>I did NPT for 100 ps with folowing parameter <br><br>; Temperature coupling is on<br>tcoupl        = V-rescale    ; modified Berendsen thermostat<br>tc-grps        = Protein Non-Protein    ; two coupling groups - more accurate<br>
tau_t        = 0.1    0.1    ; time constant, in ps<br>ref_t        = 310     310    ; reference temperature, one for each group, in K<br>; Pressure coupling is on<br>pcoupl        = Parrinello-Rahman    ; Pressure coupling on in NPT<br>
pcoupltype    = isotropic    ; uniform scaling of box vectors<br>tau_p        = 2.0        ; time constant, in ps<br>ref_p        = 1.0        ; reference pressure, in bar<br><br><br>I got foolowing result by using g_energy <br>

<br>Energy                      Average   Err.Est.       RMSD  Tot-Drift<br>-------------------------------------------------------------------------------<br>Pressure                   -3.99675       0.66    518.604   -2.89716  (bar)<br>
<br><br>Is it is right??<br>Is the system is equilibrated or I need to give more time ?????<br>