My system is made of one ligand and the protein. <br><br><div class="gmail_quote">On Tue, Jun 12, 2012 at 3:39 PM, Steven Neumann <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:s.neumann08@gmail.com" target="_blank">s.neumann08@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Dear Gmx Users,<br><br>Do I have to get rid of pbc from my trajectory in order to calculate number of hydrogen bonds using g_hbond? I mean: Does pbc has any influence on the number of hydrogen bonds?<br>
<br>Thank you<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br><br>
Steven<br>
</font></span></blockquote></div><br>