trjconv -dt<br><br>use dt flag with the utility trjconv<br><br>Chandan<br clear="all"><br>--<br>Chandan kumar Choudhury<br>NCL, Pune<br>INDIA<br>
<br><br><div class="gmail_quote">On Fri, Jun 15, 2012 at 12:07 PM, a a <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:patd_2@hotmail.com" target="_blank">patd_2@hotmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">




<div><div dir="ltr">
try ptraj<br><br><div><div></div><hr>Date: Fri, 15 Jun 2012 10:18:40 +0400<br>Subject: Re: [gmx-users] analysing of the long trajectories<br>From: <a href="mailto:jmsstarlight@gmail.com" target="_blank">jmsstarlight@gmail.com</a><br>

To: <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org" target="_blank">gmx-users@gromacs.org</a><div><div class="h5"><br><br>By the way,<br><br>I&#39;m also looking for a most trivial way for extraction of pdb files from my trajectory on the desired intervals. E.g I have trajectory consisted of 5000 frames and I want to obtain 10 pdb files every each 500 frames ( or selected time interval as the alternative ).<br>


<br>Commonly I do it manually via VMD ( save pdb option) but is there any automatic way to do it expecially for a long trajectories?<br><br><br>James<br>
<br></div></div><div class="im">-- 
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org" target="_blank">gmx-users@gromacs.org</a>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the 
www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org" target="_blank">gmx-users-request@gromacs.org</a>.
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a></div></div>                                               </div></div>
<br>--<br>
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br></blockquote></div><br>