Dear Sir/Madam<br><br>I checked up in the system, there was one version of gromacs in /opt/bio/. I removed that and I reinstalled gromacs using the following commands:<br>tar -xvf gromacs-4.5.5.tar.gz<br> cd gromacs-4.5.5<br>
  ./configure --program-suffix=&quot;_mpi&quot;<br>  make<br>  make mdrun -j 8<br> make install<br>   make install-mdrun<br>   make links<br><br>But now, its not running any commands. I made links and I made entry into the .bashrc file by putting up the following command:<br>
export GMXRC=/usr/local/gromacs/bin/GMXRC<br><br>Now, I am unable to run any coomand of gromacs. What could be the possible solution.<br><br>Thanking you<br><br>Regards<br>-- <br>Nidhi Jatana<br>Senior Research Fellow<br>
Bioinformatics Center<br>Sri Venkateswara College<br>(University of Delhi)<br>Dhaula Kuan<br>New Delhi-110021.<br><br>