Dear Gromacs users!<br><br><br>I&#39;m simulatting membrane receptor in the explicit membrane surrounded by water. Durring this MD run I&#39;ve noticed that individual waters move into the receptor interiour from the surroundings leaflets ( In my case mainly from upper leaflet). How I could examine dynamics of such burried waters ( e.g calculate wich exactly water mollecule moves into protein interiour and on what timescale this dynamics is observed ) as well as obtain time-life of such burried water into the receptor interiour?  Also I wounder to know if it possible to obtain information about dynamics non-covalent interactions of such water ( define interaction residues with such water )<br>
<br><br>Thanks for help,<br><br><br>James<br>