<html>
  <head>

    <meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=UTF-8">
  </head>
  <body bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
    <br>
    <div class="moz-forward-container"><br>
      <br>
      -------- Original Message --------
      <table class="moz-email-headers-table" border="0" cellpadding="0"
        cellspacing="0">
        <tbody>
          <tr>
            <th align="RIGHT" nowrap="nowrap" valign="BASELINE">Subject:
            </th>
            <td>Re: gromacs installation in CyTera</td>
          </tr>
          <tr>
            <th align="RIGHT" nowrap="nowrap" valign="BASELINE">Date: </th>
            <td>Mon, 17 Dec 2012 12:41:03 +0200</td>
          </tr>
          <tr>
            <th align="RIGHT" nowrap="nowrap" valign="BASELINE">From: </th>
            <td>George Tsouloupas <a class="moz-txt-link-rfc2396E" href="mailto:g.tsouloupas@cyi.ac.cy">&lt;g.tsouloupas@cyi.ac.cy&gt;</a></td>
          </tr>
          <tr>
            <th align="RIGHT" nowrap="nowrap" valign="BASELINE">To: </th>
            <td>Paraskevi Gkeka <a class="moz-txt-link-rfc2396E" href="mailto:pgkeka@bioacademy.gr">&lt;pgkeka@bioacademy.gr&gt;</a></td>
          </tr>
          <tr>
            <th align="RIGHT" nowrap="nowrap" valign="BASELINE">CC: </th>
            <td>Thekla Loizou <a class="moz-txt-link-rfc2396E" href="mailto:t.loizou@cyi.ac.cy">&lt;t.loizou@cyi.ac.cy&gt;</a></td>
          </tr>
        </tbody>
      </table>
      <br>
      <br>
      <pre>Ευχαρίστησή μας!

##################################################
module purge
module load torque


ver=mpi_d
module load FFTW/3.3.1-gompi-1.1.0-FLOAT CMake/2.8.4-gompi-1.1.0 CUDA/4.2
#module load cmake gcc fftw/3.3-gcc-openmpi


rm gromacs-$ver
mkdir gromacs-$ver
#ln -s /gpfs/scratch/GPUWorkshop/gromacs-$ver .
cd gromacs-$ver
cmake .. -DGMX_MPI=ON -DGMX_OPENMP=ON -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=./install
make
make install
##################################################

I am not sure I left this in a working state. Let me know whether it 
works on not..

thanks,
George.


On 12/17/2012 12:33 PM, Paraskevi Gkeka wrote:
&gt; Giwrgo geia,
&gt;
&gt; katarxas sygxarhthria gia th diorganwsh tou workshop - htan pragmatika 
&gt; poly xrhsimo gia thn poreia tou project mas. H8ela na sou zhthsw an 
&gt; mporeis na mou steileis to script me ta commands gia to compilation 
&gt; tou Gromacs.
&gt;
&gt; Euxaristw,
&gt; Evi
&gt;


</pre>
      <br>
    </div>
    <br>
  </body>
</html>