<div><p style="margin-bottom:0in;">Hello,users!</p><p style="margin-bottom:0in;">I have a little question. I want to do PMF for system, where double helix DNA (its length approximately is 4 nm) is pulled to the lipid bilayer (its area approximately is 6nmX6nm). Molecule DNA is placed in parallel to the bilayer. It is known that in case lipid bilayer for the better to use pull-geometry=cylinder. My question is: This is correct use pull-geometry=cylinder,where pull molecule is long and asymmetric?</p><p lang="en" style="margin-bottom:0in;"><a></a>Do I understand correctly that the only role of pull-geometry=cylinder to set accurate the reference group mass center?</p><p lang="en" style="margin-bottom:0in;"><span lang="en"><span>If</span> <span>I'm wrong,</span> <span>please</span> <span>correct me.<br /></span></span></p><p style="margin-bottom:0in;">Thanks for the reply!</p><p style="margin-bottom:0in;">Alexandra Antipina</p></div>