<html><head></head><body><div style="font-family: Verdana;font-size: 12.0px;"><div>
<div>Dear all,</div>

<div>&nbsp;</div>

<div>Is it possible to remove the rotation of a molecule?</div>

<div>I found the mdp option: <span class="suster">&quot;comm_mode = Angular&quot; and tried it but I am not sure wheather </span></div>

<div><span class="suster">I can use this option with my system: </span></div>

<div><span class="suster">I am considering a very long chain (~300 monomers) . I performed coase graining and </span></div>

<div><span class="suster">simulated the solvent implicit. I thought that the option: &quot;comm_mode = Angular&quot; can only </span></div>

<div><span class="suster">be used when considering one molecule in vacuum, right?</span></div>

<div>Why is the chain rotating?</div>

<div>&nbsp;</div>

<div><span class="suster">I found this:</span></div>

<div>&nbsp;</div>

<div>http://skryb.info/m/gmx-users@gromacs.org/3EC0AE25.2020304@chem.rug.nl</div>

<div>&nbsp;</div>

<div>
<div>during my searching for answers but I don&#39;t understand the meaning of</div>

<div>&nbsp;</div>

<div>&quot;<span class="suster">..You would need to have a modified version of Gromacs...&quot;</span></div>

<div>&nbsp;</div>

<div><span class="suster">I have the latest gromacs version....?</span></div>

<div>&nbsp;</div>

<div><span class="suster">Thank you in advance! </span></div>

<div>&nbsp;</div>

<div><span class="suster">Best, </span></div>

<div><span class="suster">Liz</span></div>
</div>
</div></div></body></html>