<div>Is there a way to split the coordinates, velocities, and forces into separate .trr files?</div><div> </div><div>-- </div><div>Mohd Farid Ismail</div><div> </div><div> </div><div> </div><div> </div><div>26.01.2018, 15:00, "Mohd Farid Ismail" &lt;mohd.farid.ismail@yandex.com&gt;:</div><blockquote type="cite"><div>That does it. Thank you for your quick reply.</div><div> </div><div>-- </div><div>Mohd Farid Ismail</div><div> </div><div> </div><div> </div><div> </div><div>26.01.2018, 13:19, "Shrinath Kumar" &lt;<a href="mailto:shrinath.kumar@ucdconnect.ie">shrinath.kumar@ucdconnect.ie</a>&gt;:</div><blockquote type="cite"><p>1. No, they are written at whatever frequency you specify in your mdp file.<br />Look at the nstxout, nstvout and nstfout options. You can choose to write<br />them to the .trr file at each step if you wish.<br />3. You can use gmx traj -ov -of<br /><br />On 26 January 2018 at 04:55, Mohd Farid Ismail &lt;<a href="mailto:mohd.farid.ismail@yandex.com">mohd.farid.ismail@yandex.com</a></p><blockquote> wrote:</blockquote><p> </p> <blockquote> Hi,<br /><br /> I don't understand the documentation about the .trr file. The manual<br /> mentions that the .trr file contains the coordinates and velocities, and<br /> optionally the forces. A few quetions:<br /> 1) Does this mean that the velocities are written at each step just like<br /> the coordinate, and that the information is written to the .trr file?<br /> 2) What switch to the mdrun do I use to have the forces for each step are<br /> written to the .trr file?<br /> 3) How can one extract these velocities and forces into separate files?<br /><br /> I've googled a little bit but couldn't find any definitive information.<br /><br /> --<br /> Mohd Farid Ismail<br /><br /><br /><br /> --<br /> Gromacs Users mailing list<br /><br /> * Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/">http://www.gromacs.org/</a><br /> Support/Mailing_Lists/GMX-Users_List before posting!<br /><br /> * Can't post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br /><br /> * For (un)subscribe requests visit<br /> <a href="https://maillist.sys.kth.se/mailman/listinfo/gromacs.org_gmx-users">https://maillist.sys.kth.se/mailman/listinfo/gromacs.org_gmx-users</a> or<br /> send a mail to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br /> </blockquote><span>--<br />Gromacs Users mailing list</span><p><br />* Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/GMX-Users_List">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/GMX-Users_List</a> before posting!<br /><br />* Can't post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br /><br />* For (un)subscribe requests visit<br /><a href="https://maillist.sys.kth.se/mailman/listinfo/gromacs.org_gmx-users">https://maillist.sys.kth.se/mailman/listinfo/gromacs.org_gmx-users</a> or send a mail to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.</p></blockquote>,<span>--<br />Gromacs Users mailing list</span><p><br />* Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/GMX-Users_List">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/GMX-Users_List</a> before posting!<br /><br />* Can't post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br /><br />* For (un)subscribe requests visit<br /><a href="https://maillist.sys.kth.se/mailman/listinfo/gromacs.org_gmx-users">https://maillist.sys.kth.se/mailman/listinfo/gromacs.org_gmx-users</a> or send a mail to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.</p></blockquote>