<html>
<head>
    <meta http-equiv='Content-Type' content='text/html; charset=UTF-8'>
</head>
<body>
<style>
    font{
        line-height: 1.6;
    }
    ul,ol{
        padding-left: 20px;
        list-style-position: inside;
    }
</style>
<div style = 'font-family:微软雅黑,Verdana,&quot;Microsoft Yahei&quot;,SimSun,sans-serif;font-size:14px; line-height:1.6;'>
    <div ></div><div>
    <div>&gt;I am guessing the issue a bit from the brief title, let me know if  </div><div>&gt;installing the external program required to run dssp as described below  </div><div>&gt;is addressing the issue or if this is something that used to work in  </div><div>&gt;GROMACS 2019 and suddenly stopped working, in which case I would need  </div><div>&gt;quite a bit more information.</div><div>&gt;Dssp in gromacs relies on an external program to run which you can find  </div><div>&gt;here: http://swift.cmbi.ru.nl/gv/dssp , just installing GROMACS does not  </div><div>&gt;suffice.</div><div>Thinks&nbsp;<span style="orphans: 2; white-space: pre-wrap; widows: 2; line-height: 1.6;">Christian!</span></div><div><span style="orphans: 2; white-space: pre-wrap; widows: 2; line-height: 1.6;">I post some information as following:</span></div><div><div style="color: rgb(49, 53, 59); font-family: Verdana, 'Microsoft Yahei', SimSun, sans-serif; line-height: 22.4px;">&nbsp; This "gmx do_dssp" tool of gmx2020 will report an error "Segmentation fault" and no xpm and xvg file generated. I tesetd 2.0.4 and later version of dssp. The gmx2018 and gmx 2019 can work correctly.&nbsp;</div><div style="color: rgb(49, 53, 59); font-family: Verdana, 'Microsoft Yahei', SimSun, sans-serif; line-height: 22.4px;">&nbsp; Then I checked gmx_do_dssp.cpp code and found some parts of matrix changed a lot, I think this code may have a problem.</div><div style="color: rgb(49, 53, 59); font-family: Verdana, 'Microsoft Yahei', SimSun, sans-serif; line-height: 22.4px;">&nbsp; Thanks</div></div><div style="color: rgb(49, 53, 59); font-family: Verdana, 'Microsoft Yahei', SimSun, sans-serif; line-height: 22.4px;"><br></div><div style="color: rgb(49, 53, 59); font-family: Verdana, 'Microsoft Yahei', SimSun, sans-serif; line-height: 22.4px;">&nbsp; Yujie Liu</div>
    <div>
        <span>
            <br>
        </span>
    </div>
    <div id="ntes-pcmac-signature" style="font-family:'微软雅黑'">
     
    <div style="font-size:14px; padding: 0;  margin:0;line-height:14px;">
        <div style="padding-bottom:6px;margin-bottom:10px;border-bottom:1px solid #e6e6e6;display:inline-block;">
                    <a href="https://maas.mail.163.com/dashi-web-extend/html/proSignature.html?ftlId=1&amp;name=liuyujie714&amp;uid=liuyujie714%40gmail.com&amp;iconUrl=https%3A%2F%2Fmail-online.nosdn.127.net%2Fsm3b2b43cae8fee0e26016821483475e93.jpg&amp;items=%5B%22liuyujie714%40gmail.com%22%5D" style="display:block;background:#fff; max-width: 400px; _width: 400px;padding:15px 0 10px 0;text-decoration: none; outline:none;-webkit-tap-highlight-color:transparent;-webkit-text-size-adjust:none !important;text-size-adjust:none !important;">
            <table cellpadding="0" style="width: 100%; max-width: 100%; table-layout: fixed; border-collapse: collapse;color: #9b9ea1;font-size: 14px;line-height:1.3;-webkit-text-size-adjust:none !important;text-size-adjust:none !important;">
                <tbody style="font-family: 'PingFang SC', 'Hiragino Sans GB','WenQuanYi Micro Hei', 'Microsoft Yahei', '微软雅黑', verdana !important; word-wrap:break-word; word-break:break-all;-webkit-text-size-adjust:none !important;text-size-adjust:none !important;">
                    <tr class="firstRow">
                            <td width="38" style="padding:0; box-sizing: border-box; width: 38px;">
                                <img width="38" height="38" style="vertical-align:middle; width: 38px; height: 38px; border-radius:50%;" src="https://mail-online.nosdn.127.net/sm3b2b43cae8fee0e26016821483475e93.jpg">
                            </td>
                            <td style="padding: 0 0 0 10px; color: #31353b;">
                                <div style="font-size: 16px;font-weight:bold; width:100%; white-space: nowrap; overflow:hidden;text-overflow: ellipsis;">liuyujie714</div>
                            </td>
                    </tr>
                        <tr width="100%" style="font-size: 14px !important; width: 100%;">
                            <td colspan="2" style="padding:10px 0 0 0; font-size:14px !important; width: 100%;">
                                    <div style="width: 100%;font-size: 14px !important;word-wrap:break-word;word-break:break-all;">liuyujie714@gmail.com</div>
                            </td>
                        </tr>
                </tbody>
            </table>
        </a>
        </div>
    </div>
    <div style="font-size:12px;color:#b5b9bd;line-height:18px;">
        <span>签名由</span>
        <a style="text-decoration: none;color:#4196ff;padding:0 5px;" href="https://mail.163.com/dashi/dlpro.html?from=mail81">网易邮箱大师</a>
        <span>定制</span>
    </div>
 </div>
</div><!--😀-->
</div>
</body>
</html>